Страница 5 из 20
Вычислительный узел
«Рабочая лошадка» кластера – счётное поле. Как правило, тут все узлы одинаковой конфигурации, но иногда в поле могут входить узлы двух и более конфигураций. Чем однороднее состав вычислительных узлов, тем проще ими управлять, тем проще работать планировщику. Создавать смешанные конфигурации стоит только в тех случаях, когда вы уверены, что все(!) они будут активно использоваться заданиями.
Аппаратная начинка вычислительного узла полностью определяется характером заданий, которые будут решаться на кластере, но всегда нужно стараться сбалансировать состав «железа», чтобы не возникло узких мест, например, таких, как большое число ядер при узком канале в память, недостаточная ширина канала в вычислительную сеть и т. п. Наличие жёсткого диска имеет как плюсы, так и минусы. Минусы – дополнительное место и энергопотребление с тепловыделением, а также высокая вероятность выхода из строя. В блейд-конфигурациях всё это особенно актуально. Плюсы – возможность установить локальную копию ОС, что сильно упрощает процедуру включения, ускоряет загрузку системных библиотек (а значит, и старт программ), а также возможность добавить swap-пространство и локальный каталог /tmp. Это значительно повышает эффективность работы памяти.
При установке локальной копии ОС следует быть очень осторожным при обновлениях ПО и локальном хранении учётных данных. Для повышения эффективности конфигурация ПО должна быть максимально облегчена: чем меньше лишних сервисов, тем лучше.
На вычислительном узле вполне можно отказаться от таких сервисов, как почта (можно отправлять сообщения через головной узел), cron (самые важные задания можно выполнять по ssh также с головного узла), udev, acpid и т. п. Оставьте только самые необходимые, а вместо udev, если возможно, используйте заранее созданные файлы устройств – они всё равно не будут меняться со временем. Самые важные сервисы для вычислительного узла – sshd и клиент сетевой файловой системы. Очень желательно настроить мониторинг работы узла. В некоторых современных дистрибутивах отключить udev невозможно: от него зависят важные сервисы (systemd, например). В этом случае оставьте его, не пытайтесь «обмануть» систему. Как правило, все вычислительные узлы логически объединяются в разделы (или очереди) в рамках системы управления заданиями. Если в поле есть узлы разных конфигураций, то удобно создать разделы для каждой конфигурации отдельно. Иногда бывает полезным объединить несколько вычислительных узлов в один раздел для запуска небольших тестовых заданий (тестовая очередь), при этом полезно ограничить время счёта таких тестовых заданий (например, 15–20 минут).
Служебные узлы
Все узлы, не включённые в счётное поле, – служебные. Совмещать функции вычислительного и служебного узла (например, NFS-сервера) крайне не рекомендуется, так как это наверняка приведёт к разбалансировке работы заданий и повышению вероятности отказа сервиса. Существует несколько ролей, которые выполняют служебные узлы, но часто один сервер выполняет несколько ролей, а то и все сразу.
Рассмотрим типичные роли. В больших вычислительных комплексах не всегда бывает удобно нагружать управляющие узлы пользовательскими и служебными системными процессами. Например, если установлены вычислительные узлы с разными версиями операционных систем, то совсем неудобно производить сборку пользовательских программ на управляющем узле, логичнее выделить несколько узлов для компиляции программ (узлы компиляции).
Для защиты от несанкционированного доступа к системным службам и чувствительным данным (например, база данных паролей пользователей) обычно функции управляющих узлов разносят на две группы: узлы доступа и узлы управления. Узлы доступа предназначены для входа пользователей и их дальнейшей работы в системе, а узлы управления – для работы системы управления заданиями.
Практически в любом кластере есть сетевая файловая система, а значит, и сервер для неё, а нередко – целая ферма, если файловая система распределённая. Довольно распространённым служебным узлом является лицензионный сервер, на котором располагаются специальные службы, отвечающие за лицензирование коммерческих программ и утилит. Например, может использоваться сервер лицензий FlexLM для нескольких коммерческих пакетов. Расположение лицензионных служб на отдельной машине оправдано как с точки зрения безопасности (защита от кражи лицензионных файлов), так и с точки зрения повышения отказоустойчивости комплекса в целом. Обязательно запишите MAC-адрес этого сервера, при его внезапной замене для большинства программ будет достаточно установить на новом сервере старый MAC-адрес. И не забудьте запросить перевыпуск лицензии для нового сервера, конечно, с его настоящим MAC-адресом.
В современных вычислительных комплексах довольно часто встречаются узлы подготовки входных и обработки выходных данных (так называемые узлы пред/постобработки, от англ. pre- и postprocessing). Такие узлы отличаются бóльшим объёмом оперативной памяти, чем на остальных узлах (256 Гбайт и более), что крайне важно для подготовки больши́х заданий и обработки результатов расчётов.
Часто полезными являются так называемые узлы визуализации. Обычно это выделенные серверы со специальными графическими картами для обработки визуальной информации и выдачи готовой картинки через сеть удалённому пользователю. Это бывает удобным, в частности, для удалённой подготовки заданий к расчёту (например, для визуализации сеток и иных входных данных). Узлы визуализации могут играть роль узлов пре/постобработки.
Для организации распределённого хранилища данных могут быть использованы узлы хранения данных. К каждому такому узлу подключается своё собственное дисковое хранилище, а все узлы хранения объединяются в единую сеть с общим доступом к файловой системе со всех узлов (подробнее об этом – в следующем разделе).
Среди служебных узлов также могут быть выделенные узлы:
• резервного копирования;
• удалённой загрузки;
• развёртывания ПО;
• авторизации и аутентификации;
• удалённого журналирования;
• сбора и обработки данных мониторинга;
• сбора и отображения статистики и состояния оборудования;
• служебных баз данных;
• и др.
Всё зависит от того, какие нужды у пользователей и администраторов вычислительного комплекса.
Сетевое оборудование
Компьютерные сети позволяют организовать взаимодействия компьютеров между собой. Для их построения применяется специальное оборудование: это сетевые карты и коммутаторы. В кластерах, как правило, имеются как минимум две сети. Одна, называемая служебной, выполняет те же функции, что и обычная локальная компьютерная сеть, другая обеспечивает обмен данными между вычислительными заданиями на разных узлах.
Наиболее серьёзные требования предъявляются к коммуникационной сети. Для характеристик возможностей сетей используются два основных параметра: пропускная способность и латентность.
Пропускная способность характеризует, какой наибольший объём информации может быть передан в единицу времени (чаще всего это секунда). Производители сетевого оборудования нередко указывают пиковую пропускную способность. В реальных приложениях, как правило, наблюдается скорость в 1,5‒2 раза ниже пиковой. Термин латентность (задержка) – это чистое время на передачу сообщения нулевой длины. Оно в первую очередь зависит от времени, затрачиваемого сетевыми устройствами и системой на подготовку к передаче и получению информации.
Пропускная способность и латентность позволяют оценить, насколько эффективно будут считаться задания на кластере. Если задание требует частого обмена данными между узлами, то использование сетевого оборудования с большой латентностью приведёт к тому, что бóльшая часть времени будет тратиться не на передачу данных, а на подготовку, а узлы будут простаивать. При малой пропускной способности обмен данными между узлами не будет успевать за скоростью счёта задания, что тоже скажется отрицательно на производительности: узлы будут тратить много времени на ожидание данных по сети.